Подобное развитие событий серьезно встревожило сановный Петербург, и вскоре по инициативе нового министра иностранных дел князя А.Б. Лобанова-Ростовского правительства трех великих держав — России, Франции и Германии в ультимативной форме потребовали от японского правительства пересмотреть условия подписанного договора и отказаться от Ляодунского полуострова. Не желая идти на обострение отношений с Петербургом, Парижем и Берлином, токийское правительство императора Муцихито (1867―1912) пошло на уступки европейским державам и аннулировало этот договор.
Отношения между Петербургом и Пекином стали приобретать все более тесный и дружественный характер. С согласия обеих сторон начался период мирной экономической экспансии России в Китай, инициатором и проводником которой стал тогдашний министр финансов и фактический глава русского правительства С.Ю. Витте.
В мае 1896 г. на коронационных торжествах в Москве министры иностранных дел Китая и России Ли Хунчжан и А.Б. Лобанов-Ростовский подписали секретный Московский договор об оборонительном союзе двух стран и о строительстве на территории Маньчжурии (от Читы до Харбина) Китайской Восточной железной дороги (КВЖД). В 1898 г. Россия подписала с китайской стороной новую конвенцию, которая предусматривала передачу российской стороне в аренду Ляодунский полуостров, а также строительство южной ветки КВЖД от Харбина до Порт-Артура. В 1900 г. Россия начала строительство внутренней и внешней оборонительных линий Порт-Артура и под предлогом охраны КВЖД ввела в Харбин части своих войск.
Япония, пристально наблюдавшая за успехами российской дальневосточной политики, предприняла ряд ответных шагов. В январе 1902 г. токийское правительство Т. Кацуро заключило с английским правительством Р. Солсбери Лондонский союзный договор, по условиям которого Великобритания обязалась сохранять дружественный нейтралитет в случае возникновения войны Японии с одной державой, и вступить в войну на ее стороне, если таких держав окажется две или три.
В правящих кругах Российской империи возникли две придворные группировки, которые отстаивали совершенно разные позиции относительно дальнейшей политики России в Дальневосточном регионе. Первая группировка, в состав которой входили министр финансов Сергей Юльевич Витте, новый министр иностранных дел Владимир Николаевич Ламздорф и военный министр Алексей Николаевич Куропаткин, полагала, что не следует обострять ситуацию на Дальнем Востоке и провоцировать Японию на военный конфликт с Россией, а следует продолжить мирную экономическую экспансию в этом стратегически важном регионе.
Однако с 1902 г. все больший вес в решении важнейших государственных вопросов стала приобретать вторая группировка — так называемая «безобразовская клика», в состав которой входили статс-секретарь Алексей Михайлович Безобразов, великий князь Александр Михайлович, председатель Комитета министров Иван Николаевич Дурново, министр внутренних дел Вячеслав Константинович Плеве, министр императорского двора и уделов Илларион Иванович Воронцов-Дашков и другие влиятельные лица «придворной камарильи». В пику сторонникам взвешенной и разумной политики на Дальнем Востоке, которые считали, что России нужна длительная мирная передышка для осуществления реформ, представители «безобразовской клики» стали сознательно провоцировать Японию на военный конфликт.
В частности, вопреки мнению С.Ю. Витте, В.Н. Ламздорфа и А.Н. Куропаткина, в мае 1903 г. на особом совещании под председательством Николая II было отклонено требование токийского правительства о выводе российских войск с территории Маньчжурии и принято решение об усилении влияния России в этой китайской провинции. На этом же совещании А.М. Безобразов был назначен статс-секретарем Особого комитета по делам Дальнего Востока, и фактически стал определять политику России в этом важнейшем регионе.
В июле 1903 г. японское правительство предложило России начать переговоры о разграничении сфер влияния на Корейском полуострове и в Северо-Восточном Китае. Российское правительство дало согласие на ведение таких переговоров, но в августе 1903 г. ситуация резко изменилась, поскольку:
• фактическую отставку получил министр финансов С.Ю. Витте, которого переместили на малозначительную должность председателя Комитета министров;
• императорским наместником на Дальнем Востоке был назначен активный сторонник «маленькой победоносной войны» с Японией адмирал Е.И. Алексеев.
Переговоры с японцами, продолжавшиеся до конца 1903 г., шли очень напряженно. Разумное предложение В.Н. Ламздорфа отдать им на «съедение» Корею в обмен на Маньчжурию было отклонено, и тогда, не дождавшись положительного ответа на свои предложения, 31 декабря 1903 г. токийский кабинет направил в Петербург ультиматум о выводе русских войск с территории Маньчжурии. После долгих и острых дебатов 22 января 1904 г. было принято решение пойти на уступки японской стороне, но было уже слишком поздно: 24 января 1904 г. Япония разорвала дипломатические отношения с Россией, что фактически означало начало войны.
К началу войны России имела на Дальнем Востоке 100-тысячную группировку войск при 150 артиллерийских орудиях, которая была рассредоточена на огромной территории Маньчжурии, Квантунского полуострова, Приморья и Приамурья. Руководство российского военного ведомства было абсолютно уверено в том, что в случае начала войны с Японией оно сможет достаточно быстро и эффективно организовать переброску войск на театр боевых действий. Однако реальная пропускная способность недостроенной Транссибирской магистрали составляла всего несколько эшелонов в сутки, поэтому для переброски всего одной пехотной дивизии требовалось не менее десяти суток.